全基因组甲基化测序

宏基因组测序服务全基因组甲基化测序(Whole Genome BS-Seq, WGBS)是将重亚硫酸盐(Bisulfite)处理方法和 Illumina 高通量测序平台相结合,对有参考基因组信息的物种进行全基因组范围内的甲基化水平的测序,可以精确构建全基因组甲基化图谱。服务优势高分辨率和准确度:单碱基分辨率精确检测每一个甲基化位点的状态。高覆盖度:该技术可在全基因组水平上最大限度的获取完整的甲基化


宏基因组测序服务

全基因组甲基化测序(Whole Genome BS-Seq, WGBS)是将重亚硫酸盐(Bisulfite)处理方法和 Illumina 高通量测序平台相结合,对有参考基因组信息的物种进行全基因组范围内的甲基化水平的测序,可以精确构建全基因组甲基化图谱。


服务优势
  • 高分辨率和准确度:单碱基分辨率精确检测每一个甲基化位点的状态。

  • 高覆盖度:该技术可在全基因组水平上最大限度的获取完整的甲基化信息,精确绘制全基因组甲基化图谱。


技术参数


     常见环境样本(请使用干冰或冰袋运送)


  • 环境样本:土壤5-10 g,污泥/沉积物5-10 g,水体-滤膜过滤至有可见覆盖物,粪便3-5 g,血液10 mL;


  • DNA:总量 ≥ 1 μg,浓度 ≥ 10 ng/μL,OD260/280=1.8-2.0并确保DNA无降解,无污染



测序策略

推荐数据量

PE100或PE150

≥30×


文献案例

肿瘤的生长和发展涉及到肿瘤上皮与周围微环境之间的动态交互作用。与非恶性前列腺成纤维细胞(NPFs)相比,来自局限性前列腺癌的成纤维细胞(CAFs)在全基因组范围内表现出明显的、持久的DNA甲基化变化,在增强子和启动子上尤为显著。CAFs的独特甲基化为肿瘤微环境提供了一种新的表观遗传标记,并有望提供新的生物标志物来改善诊断方式。

图片关键词

参考文献:

Pidsley Ruth,Lawrence Mitchell G,Zotenko Elena et al. Enduring epigenetic landmarks define the cancer microenvironment.[J] .Genome Res, 2018, 28: 625-638.




联系方式

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