转录组测序，对某一物种或特定细胞在某一功能状态下产生的mRNA进行高通量测序，既可以提供定量分析，检测基因表达水平差异，又可以提供结构分析，能发现稀有转录本，精确地识别可变剪切位点、基因融合等，而且不依赖于参考基因组。
| 文库样本送样建议 |
1. 对于一般文库，要求初始ssDNA浓度 ≥2 fmol/μL，每个 DNB制备体系所需文库量为 60 fmol。对于smallRNA和 illumina转化文库，要求初始ssDNA浓度 ≥3 fmol/μL，每个 DNB制备体系所需文库量为 70 fmol。T7包芯片的话要求可以制备5管DNB的ssDNA用量。 2. 文库插入片范围在100-500 bp，同时主带集中在±100bp内。 3. illumina双链DNA文库要求总量>150ng，浓度>3ng/μL。 |
| 测序策略 | 推荐数据量 |
| PE100/PE150 | 6G或10G |
在本项研究中，比较了两种主要测序仪(MGISEQ-2000和HiSeq4000)的性能，以测试MGISEQ-2000测序仪是否能提供所建议的高质量序列数据。我们用这两个平台对四个人结肠癌样本进行了RNA测序，并对测序质量和表达值进行了比较。由MGISEQ-2000和HiSeq4000产生的数据具有很高的一致性，皮尔逊相关系数在0.98到0.99之间。各种质量控制(QC)分析表明，MGISEQ-2000数据满足要求的质量控制措施。我们的研究表明，MGISEQ-2000的性能与HiSeq4000相当，MGISEQ-2000可以成为一个有用的测序平台。
参考文献：
Jeon Sol A,Park Jong Lyul,Kim Jong-Hwan et al. Comparison of the MGISEQ-2000 and Illumina HiSeq 4000 sequencing platforms for RNA sequencing.[J] . Genomics Inform. 2019, 17(3): e32.
