全基因组测序

全基因组测序全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)是对某种生物基因组中的全部基因进行测序。全基因组测序可提供所有基因组改变的碱基序列图谱,包括单核苷酸多态性(SNP)、插入和缺失(InDel)、结构变异(SV)和拷贝数变异(CNV)等。目前可应用于人类、动植物及微生物,尤其在遗传疾病鉴定、查找驱使肿瘤发展的突变及追踪疾病的暴发等方面广泛应用。检测适用服务优势稳定的产


全基因组测序

全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)是对某种生物基因组中的全部基因进行测序。全基因组测序可提供所有基因组改变的碱基序列图谱,包括单核苷酸多态性(SNP)、插入和缺失(InDel)、结构变异(SV)和拷贝数变异(CNV)等。目前可应用于人类、动植物及微生物,尤其在遗传疾病鉴定、查找驱使肿瘤发展的突变及追踪疾病的暴发等方面广泛应用。


服务优势
  • 稳定的产出高质量测序数据

  • 低重复序列率,获更多有效数据和更高覆盖度

  • 低标签跳跃

  • 满足多种样本类型的需求

  • 高准确性


技术参数
样本类型文库类型总量浓度完整性纯度
gDNAPCR/PCR-Free≥1ug≥12.5ng/ul主峰>20Kb无蛋白,RNA/盐离子等污染,样本无色透明不粘稠。


组织类型需求量
新鲜培养细胞(细胞数)≥5×106cell
新鲜动物组织(干重)≥50mg
全血≥1ml
FFPE≥10片、白片、100mm2、5~10μm厚度


文库样本送样建议

1. 对于一般文库,要求初始ssDNA浓度 ≥2 fmol/μL,每个 DNB制备体系所需文库量为 60 fmol。对于 Small RNA文库和illumina转化文库,要求初始ssDNA浓度 ≥3 fmol/μL,每个 DNB制备体系所需文库量为 70 fmol。T7包芯片的话要求可以制备5管DNB的ssDNA用量。


2. 文库插入片段范围在100-500 bp,同时主带集中在±100bp内。


3. illumina双链DNA文库要求总量>150ng,浓度>3ng/μL。


测序平台建库策略测序策略
MGISEQ-2000/BGISEQ-T7PCR/PCR-FreePE100、PE150



文献案例

研究人员通过使用相同的KOREF(韩国人参考基因组)样本以及相同的韩国参考基因组,对来自华大智造和Illumina的7款不同测序平台进行了系统比较,包括BGISEQ-500、DNBS-EQ-T7、HiSeq2000、HiSeq2500、HiSeq4000、HiSeqX10以及NovaSeq6000。 通过比较测序统计数据、 比对统计数据、 变异统计, 研究人员发现MGI和Illumina测序平台在测序质量、覆盖均匀性、GC覆盖度和变异准确性方面均有可比性,因此认为MGI平台可大范围的用于基因领域研究。


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参考文献:

Hak-Min Kim,Sungwon Jeon,Oksung Chung,et al. Comparative analysis of seven short-reads sequencing platforms using the Korean Reference Genom

e: MGI and Illumina sequencing benchmark for whole-genome sequencing. bioRxiv 2020.03.22.002840.



联系方式

热线:400-997-5889


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